Kościół pw. św. Fabiana i Sebastiana prawdopodobnie powstał w 1752 r. Rozbudowany w 1813 r. – dobudowa wieży i wieżyczki na sygnaturkę. Kojarzony z wezwaniem Świętego Rocha, którego kult został rozpowszechniony. Remontowany w 1956, 1969 (konserwacja polichromii), 1992 r. i aktualnie.

To kościół drewniany konstrukcji zrębowej. Orientowany, zbudowany na planie krzyża greckiego. Cztery ramiona boczne zamknięte prostokątnie, kryte dachami dwuspadowymi. Ramię z prezbiterium z zakrystią na osi. Cześć środkowa wyższa, ośmioboczna kryta drewnianą kopułą. Nad nią niewielka blaszana wieżyczka na sygnaturkę. Zwieńczona hełmem cebulastym i latarnią. Od frontu nadbudowana nad kruchtą niska wieża – dzwonnica konstrukcji słupowej, o drugiej mniejszej kondygnacji. Zwieńczona dachem namiotowym. Wszystkie dachy kryte gontem. W środku pozorne sklepienie kolebkowe, w ramionach stropy płaskie z fasetą. Chór muzyczny nadwieszony z parapetem o prostej linii i prospektem organowym. W tęczy krucyfiks barokowy i dwie barokowe figury biskupów patronów z XVII w. Polichromia architektoniczna z 1813 r. Ołtarz główny późnobarokowy z 2 poł. XVIII w. Dwa ołtarze boczne klasycystyczne z p. XIX w. Konfesjonały rokokowe i późnobarokowe rzeźby. W kopule na tęczy barokowy krucyfiks z XVII w.

Aktualnie kościół znów jest w remoncie. Parafia św. Jana Chrzciciela w Krotoszynie jest partnerem w Projekcie pt. „Szlakiem zabytkowych kościołów obszaru Diecezji Kaliskiej – rewaloryzacja i konserwacja zabytków drewnianych celem ochrony dziedzictwa kulturowego oraz wzrostu atrakcyjności regionu” w programie Operacyjnym Infrastruktury i Środowiska 2014-2020. Projekt ma charakter projektu zintegrowanego, obejmuje piętnaście parafii oraz klasztor oo. Franciszkanów w Kaliszu. W dekanacie krotoszyńskim włączone są parafie w Starymgrodzie i św. Jana Chrzciciela w Krotoszynie.

Całkowita wartość projektu: 12 469 232,26
Dofinansowanie projektu z UE: 10 598 847,42
Dofinansowanie z EU remontu kościoła św. Fabiana i św. Sebastiana (św. Rocha) w Krotoszynie: 683 639,95 zł.